La Fête de la Nature est soutenue historiquement et chaque année par le ministère en charge des questions de biodiversité et depuis 2017 par l'Agence française pour la biodiversité.

D'autres acteurs publics contribuent à la Fête de la Nature, sur leurs territoires ou dans leurs périmètre d'action, par le développement d'actions ou via des partenariats spécifiques.