Le Syndicat Mixte Yonne Médian a été créé le 1er janvier 2019. Il exerce la compétence GEstion des Milieux Aquatiques et la Prévention des Inondations (GEMAPI).
Son périmètre est celui du bassin-versant de l’Yonne Médian et de ses affluents, de la commune de Deux rivières (89460) aux limites nord du département. Il n'intervient pas sur la rivière Yonne, qui est un cours d'eau domanial, géré par Voies Navigables de France (VNF).
Le territoire représente plus de 627 km de cours d’eau non domaniaux, sur une superficie de 1445 km² et une population de près de 126 000 habitants. Il est découpé en 6 sous-bassins versants.